Santé

Pathogène, contagieux, antigénique… ce que l’on sait des variants Omicron

Des centaines de cas de cette sous-espèce ont été détectés en Europe et passent actuellement la cinquième vague de Covid-19 pour la sous-espèce Delta. Si l’inconnu n’a pas encore été élucidé, un profil de cette nouvelle mutation a émergé.

Le ministre de la Santé Olivier Véran a annoncé lundi que 25 cas de variants d’Omicron avaient été détectés à ce jour sur le territoire français. “Il y a plus de 400 cas confirmés en Europe à ce stade”, a-t-il déclaré, mais “probablement des milliers de cas sont en circulation et seraient en cours de diagnostic”. Cette variante du Covid-19, également connue sous le nom de B.1.1.529, inquiète de nombreuses mutations ainsi que des capacités de dissémination rapide depuis sa détection en Afrique du Sud fin novembre.

De nombreuses inconnues subsistent concernant la fonction et la pathogénicité de ce variant, mais les premières informations sont disponibles.

• D’où vient B.1.1.529 ?

La variante Omicron a été « signalée pour la première fois à l’OMS en Afrique du Sud le 24 novembre 2021 », explique l’Organisation mondiale de la santé. Cependant, “le premier cas connu et confirmé d’infection à B.1.1.529 a été identifié dans un échantillon prélevé le 9 novembre 2021”.

Le B.1.1.529 a depuis traversé les frontières et sa présence a été détectée dans 57 pays, notamment en Europe occidentale, selon le dernier recensement de l’OMS en date du 7 décembre.

Pays où des variants d'Omicron ont été détectés au 7 décembre 2021
Pays où des variants d’Omicron ont été détectés au 7 décembre 2021 © OMS

Il est difficile de savoir comment il est apparu pour l’instant. Il peut s’être développé chez des patients présentant une immunodéficience. “Cela peut avoir duré plusieurs mois, provoquant des mutations jusqu’à ce que le virus chez l’individu accumule ces 30 mutations et soit dans l’état actuel.” Hui”, a finalement expliqué mardi France Inter L’épidémiologiste Arnaud Fontanet. Sinon, dans le cas d’une “zoonose”, il peut avoir changé d’humain en animal puis muter et ensuite procéder dans le sens inverse.

Dans tous les cas, il entre dans la catégorie des COV, qui désigne en français une « variante préoccupante », c’est-à-dire soit « une infectiosité accrue », soit une « toxicité accrue ». « Diminuer l’efficacité des mesures de santé publique et sociales ou des outils de diagnostic, des vaccins et des thérapies disponibles. »

Une caractéristique de cette variété est qu’elle a beaucoup plus de mutations que les autres variétés. “Jusqu’à présent, nous avons constaté qu’il existe 32 mutations, insertions ou délétions dans les pesplomères, en particulier la mutation N501Y, qui est associée à une transmission accrue des variants alpha, bêta et gamma”, explique Santé publique France.

• Variantes « hautement contagieuses »

L’émergence de cette variante a provoqué la panique déjà présente dans la grande emprise de cinquième vague des cas de Covid-19 provoqués par la sous-espèce Delta, notamment en Europe. “Omicron semble toujours plus contagieux que Delta. En Afrique du Sud, il semble avoir remplacé Omicron”, a expliqué Frédérick Adne, chef des urgences de l’hôpital Abyssenne à Bobigny (Seine-Saint-Denis).

Omicron était “évidemment très contagieux”, probablement plus que Delta, qui est désormais proche de l’hégémonie dans le monde, a déclaré mardi à l’AFP Anthony Fauci, conseiller de la Maison Blanche sur la crise sanitaire. “Au fur et à mesure que de nouvelles variantes émergent, elles ont tendance à être plus contagieuses car elles sont en concurrence avec des variantes plus anciennes”, a ajouté le responsable des urgences de l’OMS, Michael Ryan, dans une interview à l’AFP.

Dès lors, on peut imaginer qu’Omicron prendra le pas sur Delta, la cause de la plupart des maladies infectieuses dans le monde, puisqu’il a été découvert en Inde fin 2020. Les variantes Omicron peuvent devenir majoritaires en Europe « dans les prochains mois ».Allait dans cette direction Prévisions publiées la semaine dernière par les agences de lutte contre les maladies de l’Union européenne.. Sur la base de ces modèles mathématiques, “Omicron peut provoquer plus de la moitié des infections causées par le virus SARS-CoV-2 dans l’Union européenne au cours des prochains mois.”

Cependant, cette transmission accrue (pas encore prouvée et évaluée) est “[Omicron] Cela peut être plus toxique et plus dangereux », souligne Frederick Adnet.

• Pas nécessairement sous la forme la plus toxique de Covid-19

“Actuellement, les données limitées disponibles rendent difficile l’évaluation des changements dans la gravité de la maladie dus aux mutants Omicron”, a écrit l’OMS.

Tout ce que l’on peut dire jusqu’à présent, c’est qu’aucune augmentation de la pathogénicité n’a été observée. “Il n’y a pas de mortalité associée à cet omicron jusqu’à présent, et très peu de patients sont en unité de soins intensifs”, souligne encore le Français Frederick Adne. Ainsi, “au 6 décembre, 212 cas confirmés identifiés dans 18 pays de l’Union européenne (informations sur la gravité disponibles) étaient asymptomatiques ou bénins”, a indiqué l’OMS. “Plusieurs endroits en Afrique australe signalent des symptômes plus légers”, a déclaré Michael Ryan.

Angelique Coetzee, présidente de l’Association médicale sud-africaine, a évoqué fin novembre des “symptômes bénins”. En plus d’un « malaise extrême », elle a expliqué que le patient Omicron dont elle souffrait souffrait de douleurs musculaires, d’une toux sèche ou de « démangeaisons de la gorge ». Il y avait très peu de fièvre. “Je ne dis pas qu’aucune maladie grave ne surviendra”, a-t-elle déclaré, mais “jusqu’à présent, même les patients non vaccinés présentent des symptômes bénins”.

« D’un point de vue épidémiologique, cette variété ne semble pas plus agressive que la précédente, explique Frederick Adne. Les données “.

• Diminution de l’efficacité du vaccin ?

La seule méthode connue aujourd’hui pour limiter la pathogénicité du Covid-19 est un vaccin, qui permet de réduire considérablement les cas graves en cas d’infection. Mais cette semaine, des résultats de recherche préliminaires (pas encore publiés) montrent une fuite. [immunitaire] Avec Omicron, c’est beaucoup plus étendu.

“Malheureusement, selon les premières nouvelles en provenance d’Afrique du Sud, le vaccin semble être moins efficace, mais cela semble important”, a-t-il expliqué face à la variante Omicron. France Info ce mardi Infectiologue Anne-Claude Clemu. Cependant, “La perte de protection est importante, mais partielle. Actuellement, les résultats des rappels ne sont pas encore disponibles. Les rappels peuvent fournir une protection contre les formes graves.”

Michael Ryan a tenu à rassurer sur cette question, estimant que les premières informations recueillies en Afrique du Sud « suggèrent que le vaccin semble tenir le coup d’un point de vue protecteur ». Il a reconnu que le vaccin pourrait être moins efficace contre Omicron, mais il est “presque peu probable” que le mutant échappe complètement à la protection fournie par le vaccin.

“Les données préliminaires en provenance d’Afrique du Sud ne montrent pas un taux d’inefficacité catastrophique”, a-t-il déclaré, “la meilleure arme dont nous disposons actuellement est la vaccination”, répète-t-il.

Ce mercredi, Pfizer et BioNTech ont assuré que le vaccin serait “toujours efficace” après “trois doses” et “trois doses” de la variante Omicron du virus… Cependant, cette variante n’est “probablement pas complètement neutralisée après deux doses”. “Nous continuons à développer des vaccins spécifiques à la variante Omicron et espérons qu’ils seront disponibles d’ici mars au cas où une indication serait nécessaire”, ont-ils également indiqué.

Outre les vaccins, les scientifiques rappellent l’importance de respecter les gestes barrières, qui restent parfaitement efficaces pour limiter la circulation de cette variante.

Salomé Vincendon

Salomé Vincendon journaliste de BFMTV



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